2012
Nous avons décrit en détail le cycle de phosphorylation du CTD de l’ARN polymérase II. Nos résultats démontrent que le cycle est virtuellement identique à tous les gènes et que des interrelations complexes entres les différentes kinases, phosphatases et isomérases sont requises à son établissement.
2010
Nous avons démontré que le complexe histone déacétylase Rpd3S, que l’on croyait recrutée à la chromatine via les nucléosomes méthylés, est en fait recruté en deux étapes. Rpd3S est d’abord recruté aux gènes activement transcrits via le domaine C-terminal (CTD) de l’ARN polymérase et ensuite transféré sur la chromatine méthylée. La phosphorylation du CTD et le facteur d’élongation DSIF jouent tous deux un rôle dans le contrôle du recrutement de Rpd3S.
Nous avons publié une carte des régions enrichie en gammaH2AX à l’échelle génomique. Cette carte constitue un répertoire des régions fragile du génome de la levure. Fait surprenant, les régions dont les gènes sont transcriptionellement réprimés comptent parmi les plus fragiles du génome. Cette découverte a des implications importantes dans notre compréhension de l’instabilité génomique.
2009
Nous avons découvert que la variante d’histone H2A.Z est non seulement dans les promoteurs, mais aussi dans l’hétérochromatine facultative. Fait surprenant, nous avons découvert que la transcription joue un rôle actif dans l’établissement du profil de distribution génomique de H2A.Z. L’approfondissement du mécanisme par lequel la transcription façonne la localisation de H2A.Z et de certaines autre marques épigénétiques sont présentement à l’étude dans notre laboratoire.
2007
Nous avons mesuré la dynamique des nucléosomes à l’échelle génomique, ce qui nous a permit de démontrer que les nucléosomes occupants les promoteurs sont les plus labiles du génome. Nous avons également démontré que la chaperonne Asf1 est impliquée dans ce processus. Ces découvertes ont des implications importantes sur notre compréhension du contrôle de la transcription.
2006
Nous avons fait une série de prédictions informatiques des modules de régulation du génome humain. Ces prédictions nous ont permit de dégager certaines caractéristiques des éléments régulateurs et des facteurs de transcription qui les occupent.
2005
Nous avons déterminé la localisation génomique de la variante d’histone H2A.Z chez la levure, et ainsi mis en évidence que cette dernière occupe des nucléosomes précis dans la majorité des promoteurs. Nous avons aussi démontré que la présence de H2A.Z dans ces nucléosomes peut influencer leur positionnement. Cette étude a eu un impact important sur notre compréhension de la fonction de H2A.Z.