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Biochimie des ribonucléoprotéines
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Notre laboratoire s’intéresse surtout à la levure Saccharomyces cerevisiae, qui constitue un système modèle de l’étude de la dynamique de l’association et de la dissociation des composantes préribosomales. Il nous permet de comprendre la nature de leur assemblage et les mécanismes de contrôle sous-jacents contribuant à la maturation des précurseurs des ribosomes. Nous utilisons des méthodes de protéomique et de RNomique permettant d’isoler rapidement les complexes RNP et d’étudier les réarrangements dynamiques des composantes RNP afin d’étudier les changements spatiaux et temporaux qui se produisent au cours de la maturation des ribosomes, de même que les interactions des protéines et des ARN au sein de ces complexes. Ces méthodes sont jumelées à de la modélisation informatique pour cartographier de façon dynamique « la morphologie détaillée » de l’assemblage des ribosomes. Une telle carte ferait avancer notre compréhension de la voie de la biogenèse des ribosomes et ses liens avec d’autres voies cellulaires, plus particulièrement celles de la division cellulaire. De plus, cette carte constituerait un système modèle qui permettrait de développer des méthodes et stratégies pour l’étude de la dynamique des voies macromoléculaires.

In our laboratory we predominately use the budding yeast Saccharomyces cerevisiae as a model system to study the dynamics of association and dissociation of pre-ribosome components in order to understand the nature of their assembly and the underlying control mechanisms that contribute to the maturation of pre-ribosomes. We apply proteomic and RNomic methods that allow for fast isolation of RNP complexes and the study of dynamic rearrangements of RNP components to study spatial and temporal changes during ribosome maturation as well as protein and RNA interactions within these complexes. These methods are combined with computational modeling to establish a “dynamic high-resolution morphology” map of ribosome assembly. Such a map will be a step towards a greater understanding of the ribosome biogenesis pathway, as well as its links to other cellular pathways, particular cell division. Moreover, it will serve as a model system to establish methods and strategies to study the dynamics of macromolecular pathways.

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