Décoder le rôle des isoformes alternatives dans le cancer

(Titre traduit. Cette conférence aura lieu en anglais.)

Kaia Mattioli, PhD
Chercheuse postdoctorale
Département de médecine, Division de génétique
Hôpital Brigham & Women
École de médecine de l’Université Harvard
Boston, MA, États-Unis
 

L'hôte de cette conférence est François Robert, PhD, directeur de l'Unité de recherche chromatine et expression du génome.

À propos de cette conférence
Les gènes sont souvent décrits comme les unités fonctionnelles du génome, mais il ne s’agit que d’une abstraction pratique. En réalité, les gènes sont des ensembles modulaires d’exons qui s’assemblent de multiples façons pour produire des ARNm distincts, lesquels sont ensuite traduits en isoformes protéiques distinctes. Dans le cancer, le traitement de l’ARN est souvent perturbé, ce qui entraîne une expression aberrante des isoformes. Malgré quelques exemples bien caractérisés, nous ne comprenons pas encore systématiquement comment les isoformes diversifient les fonctions de leurs gènes d’origine. Dans cette conférence, je présenterai des preuves démontrant que cette vision au niveau des gènes masque une biologie pertinente pour le cancer. Je décrirai d’abord nos efforts pour caractériser les isoformes alternatives d’une classe importante de protéines régulatrices — les facteurs de transcription — à l’aide de tests fonctionnels. Nous avons découvert que deux tiers des isoformes alternatives de facteurs de transcription diffèrent fonctionnellement des isoformes de référence et agissent souvent comme régulateurs négatifs, qui sont préférentiellement déréglés dans les tumeurs. Ces travaux motivent mon futur programme de recherche, qui exploitera et développera des approches de génomique fonctionnelle, notamment le séquençage d’ARN à longue lecture et des systèmes CRISPR ciblant l’ARN, afin de comprendre comment les isoformes individuelles contribuent à des phénotypes du cancer du sein tels que la prolifération et la résistance aux médicaments.

À propos de Kaia Mattioli
La Dre Kaia Mattioli est boursière K99/R00 dans le laboratoire de la Dre Martha Bulyk à l’Hôpital Brigham & Women et à l’École de médecine de l’Université Harvard. Kaia est fascinée par la complexité du génome humain. Elle s'intéresse à la manière dont le traitement anormal de l'ARN contribue au cancer. Ses recherches combinent la génomique fonctionnelle des isoformes, à la fois computationnelle et expérimentale, afin d’examiner comment les isoformes alternatives modulent les réseaux de régulation génique dans les cellules du cancer du sein. Kaia a obtenu son doctorat dans le laboratoire du Dr John Rinn à l'Université Harvard et son baccalauréat en sciences biologiques à l'Université Stanford.

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