Exaptation des rétrotransposons : de l’immunité au neurodéveloppement 

(Titre traduit. Cette conférence aura lieu en anglais.)

Uttiya Basu, PhD
Professeur titulaire
Département de microbiologie et immunologie
Université Columbia
New York, NY, États-Unis

L'hôte de cette conférence est Javier Di Noia, PhD . 

À propos de cette conférence
Les éléments rétrotransposables comptent parmi les composants les plus abondants et les plus dynamiques sur le plan évolutif des génomes des mammifères; pourtant, leurs rôles vont bien au-delà de leur désignation traditionnelle comme « ADN poubelle » ou ADN égoïste. Dans ce cours, nous explorerons comment les éléments rétrotransposables (rTE) — notamment les LINE, les SINE, les rétrovirus endogènes (ERV) et leurs dérivés — ont façonné le développement et le fonctionnement du système immunitaire. Nous examinerons comment le conflit évolutif entre les génomes hôtes et les éléments mobiles a favorisé l’émergence de mécanismes sophistiqués de silençage épigénétique, de surveillance de l’ARN, de détection immunitaire innée et de défense du génome. Parallèlement, nous examinerons comment des séquences et des protéines dérivées à l’origine de rétrotransposons ont été à maintes reprises cooptées pour remplir des fonctions cellulaires essentielles. Ce processus de domestication moléculaire a contribué à la régulation génique, à l’organisation de la chromatine, à la communication intercellulaire et à l’évolution de nouvelles fonctions immunitaires. Une attention particulière sera accordée à la relation entre les éléments rétrotransposables et l’immunité adaptative, notamment à leur influence sur l’hypermutation somatique des loci des récepteurs antigéniques, ainsi qu’à la réponse immunitaire innée dans le système nerveux. Un thème important sera la nature à double tranchant de ces éléments : les mêmes séquences génomiques qui doivent être restreintes afin de préserver la stabilité du génome peuvent, lorsqu’elles sont activées sur le plan transcriptionnel, générer des acides nucléiques et des motifs moléculaires qui mobilisent les voies de l’immunité innée. Enfin, nous examinerons des données émergentes indiquant que les éléments rétrotransposables peuvent être réutilisés pour créer des mécanismes biologiques entièrement nouveaux dans le système nerveux, illustrant ainsi comment le conflit génomique peut devenir une source d’innovation évolutive. L’objectif général est de considérer le génome non pas comme un répertoire statique de gènes, mais comme un écosystème en évolution dans lequel les éléments génétiques mobiles ont profondément influencé le développement et le fonctionnement du système immunitaire.

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