Un chercheur de l’IRCM publie des travaux innovants dans Viruses
Et si l’intelligence artificielle pouvait nous aider à éviter la prochaine pandémie? C’est le pari audacieux et résolument innovant du projet Interactys-AI, mené à l’Institut de recherches cliniques de Montréal (IRCM) par le Dr Benoit Coulombe (Professeur-chercheur titulaire, Département de biochimie et médecine moléculaire, Université de Montréal) et ses collaborateurs.
L’objectif : anticiper plutôt que subir. Grâce à des outils d’IA de pointe, dont AlphaFold 3 – récompensé par le prix Nobel de chimie en 2024 à des scientifiques de la biotech DeepMind –, les chercheurs cartographient les interactions entre virus et cellules humaines à l’échelle moléculaire.
Un GPS pour les protéines
Imaginez AlphaFold comme un GPS ultra-précis pour les protéines : ce système nous montre comment les protéines se plient et s’assemblent, révélant les points de contact entre un virus et nos cellules. Cette carte invisible permet à l’équipe de recherche de repérer les « portes d’entrée » que les virus utilisent pour infecter l’organisme. Une fois ces portes identifiées, l’équipe peut réorienter des médicaments déjà existants pour les bloquer, transformant ainsi des traitements connus en antiviraux potentiels, rapidement déployables.
« La pandémie de la COVID-19 nous a appris qu’il est crucial de préparer nos systèmes de santé avant qu’une crise n’éclate », explique le Dr Benoit Coulombe. « En identifiant à l’avance des cibles exploitables et des molécules disponibles, nous croyons pouvoir réduire radicalement les délais entre l’émergence d’un virus et la mise en place de traitements efficaces. »
Les premiers travaux se sont concentrés sur le virus H5N1 de la grippe aviaire, surveillé de près par les autorités sanitaires. Bien que la transmission entre humains soit encore limitée, des mutations pourraient changer la donne. Les résultats, publiés dans la revue Viruses, révèlent plusieurs protéines humaines susceptibles d’interagir avec H5N1.
Les suites à apporter à ces travaux
Prochaine étape : appliquer cette stratégie à d’autres virus, dont le SARS-CoV-2, qui continue d’évoluer rapidement.
Ces avancées sont rendues possibles grâce à l’expertise de Christian Poitras, technicien en informatique à l’IRCM, et au soutien de l’Institut.
